Ну, основные бинарники и конфиги у вас уже стоят. В том числе и ненужные :-).
При инсталляции можно отказатся от установки исходных текстов (src), системы X-Window, игрушек (games), и различной документации (manpages, doc, info, dict).

Кроме того, существует большое колличество дополнительных программ в виде пакетов (packages) и портов (ports). Но о них разговор отдельный. Смотри:
Установка "пакетов" (packages).
Установка "портов" (ports).

Итак. Добавление из дистрибутива ...

Будем считать, что дистрибутив вам доступен для просмотра и копирования. Если он находится на CD, отдельной партиции винчестера или доступен по NFS - смонтируйте его в любую подходящую директорию.

Если вы можете скопировать его через FTP или через флопики - выберите ту часть, которая вас интересует (можете посмотреть "Содержание дистрибутива FreeBSD") и скопируйте в подходящую директорию.

Что именно нужно копировать?

Если речь идет о "монолитных" частях дистрибутива (info, games, manpages и т.п), то забирайте все, что лежит в соответствующей директории дистрибутива. Если вам нужны исходники (директория src), то выберите - какой из архивов вас интересует и берите все файлы с таким названием. Например, если вам нужны исходники ядра, берите все файлы с именем ssys (ssys.aa, ssys.ab и т.д.). Кроме того, очень полезно взять еще файл install.sh из этой же директории.

Несколько слов о том, что это за файлы. На самом деле это архив *.tgz (tar-архив сжатый GNU zip'ом), только порезанный на кусочки программой split. Эти кусочки можно "склеить" обратно в единый файл командой cat после чего обращаться с ним как и с другими файлами типа tgz.

Однако, вам этого делать не обязательно.

"Извлечение"

Просто запустите командный файл install.sh из этой директории:
sh install.sh
он сам выполнит последовательно команды cat, которая "сольет" кусочки в единый файл и tar (с соответствующими ключами), которая развернет получившийся архив в нужную директорию. Если вы хотите развернуть какой-либо архив из исходников, то install.sh нужно указать в качестве аргумента имя архива (без начальной буквы "s") или all, если вы хотите развернуть все исходники. Например, для тех же исходников ядра:
sh install.sh sys

Более "тонкая" работа.

Все вышеописаные действия можно сделать и с помощью программы sysinstall. Однако, вручную можно сделать и более "тонкую" работу. Например, "вытащить" исходники только одной конкретной программы. Или "достать" из дистрибутива сдержимое директории /etc, какой она была в оригинале (если вы вдруг безнадежно испортили какой-нибудь файл при настройке).

Прежде всего, определите - в каком из дистрибутивных архивов лежит то, что вам нужно. Если речь идет об исходниках какой-то программы, найдите саму программ в своей развернутой системе (например, с помощью команды locate). По названию директории, в которой она находится, можно определить в каком из архивов искать ее исходники (см. "Содержание дистрибутива FreeBSD"). Естественно, если вам надо саму программу в бинарном виде или файлы из /etc, то их надо искать в той части дистрибутива, которая называется bin.

Теперь просмотрите соответствующий архив.
cat file.?? | tar tzvf - | more
(вместо more лучше использовать less, если он у вас уже стоит) естественно, вместо file в команде должно быть имя конкретного архива.

Если вы не обнаружили в архиве то, что искали - попробуйте просмотреть другие архивы (например, часть исходников лежит в архивах scontrib и sgnu).

Если вы нашли, то что искали, можно приступать к "извлечению" из архива. Решите, в какую директорию вы хотите положить извлеченное и запускайте команду
cat file.?? | tar xzf - -C "куда положить" "что взять"

Например:
cat sgnu.?? | tar xzf - -C /home/vasia */uucp

Обратите внимание, что в архиве может быть большое дерево из директорий, и, те файлы, которые вам нужны, могут иметь длинный "префикс" из названий поддиректорий (так файлы-исходники uucp в архиве sgnu, выглядят как gnu/libexec/uucp/...). Поэтому в команде, в том месте, где "что взять", надо либо прописать начало имени полностью - gnu/libexec/uucp, либо начать со звездочки - */uucp. Кстати, в директории, куда вы извлекаете файлы, в этом случае создастся соответствующий кусочек дерева из архива. То есть, директория gnu, в ней - libexec, а в ней - uucp со всем своим содержимым.